锡北运河站位于华府路与惠山大道交叉口北侧、惠山大道路中分隔带上，为高架三层侧式车站。车站共设置2个出入口，根据客流分析和对周边环境的调查，在车站两端的东西两侧分别设置了2个乘客出入口通道，在2号出入口布置一台垂直电梯，供残疾人使用。