肠外原虫包含有恶性疟原虫，间日疟原虫，卵形疟原虫和三日疟原虫4种疟原虫。疟原虫属于真球虫目(Eucoccidiida)、疟原虫科(Plasmodidae)、疟原虫属(Plasmodium)，是疟疾(malaria)的病原体。