替代种又称等值种（equivalent species）。由于气候变化、海陆变迁等历史原因，或由于某种生物自原生境向外扩散过程中，遇到不同生境而形成新种的结果，形成了分布很不相同，但彼此亲缘关系密切、有共同起源的种。如我国东北分布的西伯利亚刺与青海、宁夏、内蒙古分布的白刺，以及新疆东部、河西走廊的泡泡刺，它们起源于白刺，出现了在分布上彼此相互替代。