孵化酶 hatching enzyme ，指各种动物胚胎孵化时，从胚胎细胞所分泌的能够引起卵膜溶解的酶的总称。海胆的孵化酶是由囊胚期细胞所分泌，两栖类是由胚胎头部的额腺分泌的，而鱼类则由胚体的外胚层性或内胚层性的孵化腺细胞所分泌，无论由哪里分泌的孵化酶均为蛋白分解酶。