齿萼紫花苣苔为亚灌木，无匍匐的根状茎。茎高60—100厘米，四棱形，不分枝，疏被短柔毛或近无毛；叶对生，每对叶不等，具柄；叶膜质。叶柄长1．5—4厘米，疏被短柔毛。聚伞花序，花序梗长5—18厘米。花期9—11月。