黑点神仙分布在太平洋的珊瑚礁海域，分布范围包括从约翰斯顿环礁（Johnston Atoll）至社会群岛（Society Islands），以及马里亚纳群岛（Mariana Islands）和阿德默勒尔蒂群岛（Admiralty Islands）一带海域，最近报告显示在洛亚尔提群岛（Loyalty Islands）的Ouvea环礁（Ouvea Atoll)发现其踪迹。