黄素蛋白(FP)是由一条多肽结合1个辅基组成的酶类，不是脂溶性。结合的辅基可以是FAD或FMN,它们是维生素B2的衍生物，每个FMN和FAD可接受两个电子和两个质子。呼吸链上具有FMN为辅基的NADH脱氢酶。