韭菜茎枯病主要为害花茎，有时也为害叶片。茎部染病初现褪绿长椭圆形病斑，大小18～30×2．5～4．5毫米，后全部变为灰白色，上密生小黑点，即病原菌的分生孢子器。叶片染病，叶两面病斑梭形或长椭圆形，边缘不清，后也现小黑点，严重的叶片枯死，花茎折倒。