邹平县水务局为县政府水行政主管部门，下设19个科室，具体负责组织执行全县水务发展战略中长期规划、防汛抗旱、水资源管理、水利工程建设及管理、城乡供水、城区排水、污水处理、生态水环境建设、节约用水管理、水土保持及水土流失治理、农田水利建设、水行政执法及规费征收、水利科技推广、水务经济发展等。