色素蛋白质是复合蛋白质的一种，是以色素为辅基的复合蛋白质的总称。它是由单纯蛋白质和色素结合而成的，主要与呼吸作用有关。血液中的血红蛋白就属于此类蛋白质。因辅基分子团种类的不同各自显有特异的色调及生物体内氧载体或氧化还原反应、光化学反应的触酶等的生理机能。