航空署是官署名。清末宣统二年（1910年），清政府在北京南苑设飞行机小试验厂。旋改为航空传习所。民国三年（1914年），参谋本部在此创办航空学校，又于清河设厂。八年，国务院设航空事务处。十年，改名航空署。主官有督办（特任官），下有署称（简任官），机构分总务处及军事、机械、航运、经理四厅。南苑航空学校、清河航空工厂、东三省航空处，京汉航空线管理局筹备处均属该署管辖。十六年，改属军事部。