羟赖氨酸是胶原降解的另一种产物，它主要有两种糖甙形式：GHYL(糖甙羟赖氨酸)和Glc.GHYL。羟赖氨酸和它的糖甙产物在尿中含量不如羟脯氨酸高，但由于其含量所占比例固定，且不受食物来源影响，组织特异性高，所以较尿羟脯氨酸有更好的代表性。骨和皮肤中有三分之一的羟赖氨酸是糖基化了的，在皮肤Glc. gHYL/GHYL为1.6:1，而骨中为1：7。现在已研制出GHYL的单克隆抗体用于临床检测，是反映骨吸收的较为灵敏的指标。