石杉科（Huperziaceae）是蕨类植物门石松目（Lycopodiales）下的一个科，该科均属于小型或中型蕨类，附生或土生植物。该科共2属，广布于热带与亚热带。中国有2属，主产西南及华南，东北、西北及华东也有分布。有的学者将这两属合并为一属，即石杉属（Huperzia）。石杉科的模式属是石杉属（Huperzia）。