短管龙胆，多年生草本，高5-15厘米。主茎棕褐色，粗壮、密被棕黑色残存叶柄。主根较粗，黄褐色。花枝直立，不分枝。单花顶生；花萼杯状；花冠黄绿色，里面有蓝紫色斑点，钟形；雄蕊着生于冠筒中部，整齐；子房椭圆形，两端渐狭。蒴果棕色，长椭圆形或圆形，长约15毫米，扁平，2瓣开裂，具短粗的柄，柄长约4毫米；种子灰棕色，纺锤形，长1.5-2毫米，具细网纹。花果期9-11月。