甲基转移酶已知有各种不同的转甲基酶，以S-腺苷蛋氨酸、甜菜碱（betain）和二甲基噻亭（dimethylthetin）作为甲基的供体，把氨基、羟基、硫氢基（thiol）甲基化。结合在四氢叶酸上的活性C1单位的还原而生成甲基，通过5-甲基四氢叶酸转甲基酶与同型半胱氨酸（homocysteine）被甲基化而生成蛋氨酸。这种酶是以钴胺酰胺（cobami-de）作为辅酶的。