王琳琳生于北京，自幼学习音乐，6岁学习钢琴，并多次获奖。17岁起开始学习指挥，师从著名指挥家徐新教授。1999年从清华大学附中高中毕业后以总分第一名的优异成绩考入中央音乐学院指挥系本科，师从我国老一辈著名指挥家韩中杰教授。