人类松果体为长（5～8）mm、宽（3～5）mm的灰红色椭圆形小体，重（120～200）mg，其发育在7~8岁时达到顶峰。松果体位于间脑顶部，缰连合与后连合之间，四叠体上方的凹陷内，位于第三脑室顶，故又称为脑上腺，其一端借细柄与第三脑室顶相连，第三脑室凸向柄内形成松果体隐窝。松果体表面被以由软脑膜延续而来的结缔组织被膜，被膜随血管伸入实质内，将实质分为许多不规则小叶，小叶主要由松果体细胞、神经胶质细胞和神经纤维等组成。