系统替代现象与生态替代现象在原则上是有区别的：前者为近亲动物区系所特有，其相似决定于原始亲缘关系；后者的相似则决定于趋同进化，主要为地理上分隔较远的动物区系所特有。但是，两者的界限不是很清楚的，有时是一致的。