手部消毒是利用化学品或其他方法消灭手部大部份微生物，使常见的致病细菌数目减少到安全的水平数目。然而，与杀菌（Sterilization）相比，部份细菌孢子、过滤性病毒、肺结核菌及真菌等都有机会未能消灭。