昌都强巴林寺位于昌都镇内的昂曲和扎曲两水交汇处，它巍峨地依附在横断山脉之之下，耸立在古冰河切割而成的红壤层上。该寺是由宗喀巴弟子喜绕松布于公元 1444年创建的。 寺内主佛为强巴（大慈）佛，故对该寺的起名为昌都强巴林寺。