巡航导弹潜艇（英文：Guided Missile Submarine，舰船类别代号：SSG/SSGN，N代表核动力）是一种以飞航导弹为主要攻击力量的攻击性潜艇。在冷战东西方阵营中都有飞航导弹潜艇这个潜艇类型，但其作战任务是截然不同的。