寿光市审计局是市人民政府组成部门，局机关设办公室、法制与计算机审计管理科、财政金融审计科、行政事业审计科、经贸与外资运用审计科五个职能科室；下属市政府投资项目审计中心和市经济责任审计办公室两个事业单位。