宝鸡市国家税务局于1994年9月由宝鸡市税务局分设成立。现内设13个行政机构，下辖9个县、4个区国家税务局、3个直属机构、4个事业单位。2018年7月5日，国家税务总局宝鸡市税务局挂牌仪式在宝鸡举行，标志着原宝鸡市国家税务局、原宝鸡市地方税务局正式合并。