多孔鹿角珊瑚的珊瑚骼为伞房花序式的群体，分枝细长，群体四周的分枝稍长于中心的分枝，皮壳于死珊瑚石上。轴珊瑚体圆柱形，直径2mm，突出1．5—2mm，第Ⅰ轮隔片6个，狭，第Ⅱ轮隔片发育不全，珊瑚杯壁沟漕状。