吴耀利主要学术专长是新石器时代考古，现从事新石器时代考古研究。1975年8月毕业于北京大学历史系，1975年9月至1978年9月在北京市文物管理委员会工作，1978年10月至1981年8月在中国社会科学院研究生院学习，1983年被授予硕士学位。1981年8月至今在中国社会科学院考古研究所工作，现任第一研究室副主任。