生理植物病理学：是一门研究植物与病原物在个体水平相互作用过程中的生理生化问题的科学。其主要研究植物病原物产生的酶、毒素、激素、遗传转化因子等物质在侵染过程中的作用，植物在被侵染前和被侵染后的抗病物质对抵抗侵染的作用，寄主植物与病原物的识别反应以及对抗侵染所发生的生理生化反应等。