南通农村商业银行是在南通市市郊农村信用合作联社和通州市农村信用合作联社进行股份制改造的基础上，优化股权结构而成立的。组建南通农商行是南通市委、市政府顺应区划调整形势、建设金融强市的重要决策。2010年3月21日，该行获得银监会批准筹建。经过筹建准备，南通农村商业银行股份有限公司于2010年8月8日召开创立大会，宣告正式成立。这标志着南通市深化农村金融改革、加快构建区域性金融服务体系迈出新的重要一步。