医院固体废物主要指含有大量的病原体（病菌、病毒和寄生虫卵等）的这类医院排弃的固体废物。包括手术或动物实验过程中切割出的生物肌体和尸体，还包括医院污水处理过程中产生的污泥。其处理方法主要是消毒和焚烧。消毒即杀灭病原体，常用氯化消毒和臭氧消毒；焚烧法则可引起灭菌和减容作用，一般应在专用焚烧炉中进行。从事放射性同位素诊断或治疗的医院，还会产生含有放射性的废物（包括病人的排泄物），这类废物从处理放射性角度则常用贮存衰减法，但对于兼有病原体的废物和生物肌体、尸体，则应先进行消毒或焚烧法处理，再采取贮存衰减法处理。