动物系统学与进化生物学一方面要应用分类学知识为国家需求和公众教育服务，特别是重要社会性或经济性动物类群（如医学、外来种、天敌、农林业动物类群等）的分类、鉴定与编目；另一方面要加强生物进化理论研究，尤其是重要类群演化规律；特殊环境及重大地质事件影响下的物种进化理论；基因组、蛋白质组、形态功能（尤其仿生结构、功能）的进化复杂性研究。