分子间呼吸属于生物学的研究对象，英文名叫intermolecularrespiration。生物在呼吸期间的主要营养物质是糖，因此呼吸反应主要是糖的氧化反应。当氧气供应不十分充分时，这种呼吸称为缺氧呼吸，亦即分子间呼吸。在缺氧呼吸时，将产生酒精等不完全氧化物。