分司厅小学历史悠久，它始建于1914年10月12日，原校名为“京兆模范小学”。1929年4月改为“河北省立第三模范小学”。1935年因校址坐落于分司厅胡同内，故定名为“北平市分司厅小学”。1946年改名为“五区中心国民小学”。1956年增设了初中班，名为“分司厅学校”。1963年中、小学分开，小学部恢复为“北京市东城区分司厅小学”。2020年5月，入选北京市中小学科技教育示范学校名单。