在与植物共生的情况下才能固氮或才能有效地固氮，固氮产物氨可直接为共生体提供氮源。一类必须与它种生物共生在一起时才能进行固氮的微生物。种类很多。1.结瘤类：与豆科植物共生者，如根瘤菌属、固氮根瘤菌属、慢性根瘤菌属和中华根瘤菌属等；与非豆科植物共生者，如弗兰克氏菌属等。2.非结瘤类：与真菌共生者，如念珠蓝细菌属和鱼腥蓝细菌属等；与蕨类植物共生者，如满江红鱼腥蓝细菌。