六安市地方税务局组建于1994年8月，从1998年1月起，实行省地税局和六安市政府双重领导、以省地税局垂直领导为主的管理体制。2018年7月5日，新组建的国家税务总局六安市税务局挂牌成立，标志着原六安市国家税务局、六安市地方税务局正式合并。