上海交通大学学报是由上海交通大学学报（上海交通大学学报自然科学版）、上海交通大学学报（英文版）、上海交通大学学报（哲学社会科学版）、上海交通大学学报（农业科学版）、上海交通大学学报（医学版）、上海交通大学学报（医学英文版）6本期刊组成。