《三垣笔记》是明代李清创作的一部史书。该书共六卷，其中笔记三卷，附识三卷。书中所记，都是李清任三科给事中时耳闻目睹有关朝章典故和当时朝廷重要官员的言论行事，故起名为《三垣笔记》，“三垣”指李清历官刑、吏、工三垣。